BSA分析查找极端差异表现基因的方法,与参考基因组进行比对当前样本的差异变化,首先需要对测序回来的数据进行数据质控、与参考基因组进行比对、然后检测编译,最后绘图。
一,数据质控
我用的fastp,多线程,和html报告
fastp -q 15 -u 40 -M 0 -n 5 -l...
百蔬君
5年前 (2019-07-25) 592303℃ 10评论
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conda是生物信息分析必备的环境,集成了很多优秀的软件,关键是解决了依赖包的问题,很好用。记录一下我安装conda的心得。
conda有miniconda和anaconda,我推荐还是使用miniconda吧,自己去安装一些东西,可能好使用一些。
conda的下载...
百蔬君
5年前 (2019-07-21) 8948℃ 0评论
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这几天因为centos7的分区空间没有分配好,所以就删除了wdcp,分配好空间之后再安装wdcp就提示一堆的错误,具体信息如下:
installing php...
make: *** No rule to make target `clean'. Stop.
c...
百蔬君
5年前 (2019-07-19) 3872℃ 0评论
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广东农科院选育的铁心冬瓜已经推出市场多年,由于该品种空腔极小、肉质细密、瓜身细长,享得“黑美人“的美誉,大江南北皆为铁心冬瓜所欢心,经过多年的运营目前基本上已经占据冬瓜市场的半壁江山,但是在广东有一个地方除了大量种植铁心长身冬瓜外也专注出口短身冬瓜,这个地...
百蔬君
5年前 (2019-07-06) 3586℃ 0评论
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